ניתן לחלק את ההשפעות של קרינת לייזר על ריקמה ביולוגית לפי סוג האפקט הנוצר:

• אפקטים תרמיים – נוצרים על ידי לייזרים של קרינה רציפה כגון: לייזר CO₂, לייזר יאג, או לייזר יון הארגון.
  אנרגיית הלייזר נבלעת בריקמה הביולוגית, מעלה את הטמפרטורה המקומית של אזור הריקמה המוקרן ובהתאם לטמפרטורה מתרחש אחד מהתהליכים של אידוי, קרישה, וכו'.
• אפקטים מכניים – מתרחשים בעיקר כאשר פולס קצר של קרינת לייזר בעוצמה גבוהה פוגע בריקמה.
  כמות האנרגיה הגבוהה הפוגעת בשטח מצומצם גורמת לחימום מיידי של הריקמה.
  מכיוון שהחימום מתבצע בפרק זמן הקצר מהזמן הדרוש לריקמה להתפשט כתוצאה מהחימום, נוצר פיצוץ של הריקמה תוך יצירת "גל הלם" הקורע את הרקמות שסביבו.
  אפקט זה משמש לדוגמא לטיפול עיניים במקרה של קטרקט משני. פולס הלייזר יוצר גל הלם הקורע את הוילון העכור שמסתיר את שדה הראייה.
• אפקטים כימיים – משמשים בריפוי פוטודינמי (PDT) ובטיפולי עיצוב הקרנית על ידי לייזר אקסימר.