האינטראקציה בין קרינת לייזר לריקמה ביולוגית תלויה במספר גורמים:

• אורך הגל של הקרינה האלקטרומגנטית.
• עוצמת הקרינה האלקטרומגנטית.
• צורת הקרינה האלקטרומגנטית (קרינה רציפה או פולסית).

אורך הגל של הקרינה האלקטרומגנטית קובע בצורה חד ערכית את האנרגיה של כל פוטון המרכיב את הקרינה.

אנרגיית הפוטון היא הקובעת את סוג האינטראקציה בין קרינת הלייזר לריקמה הביולוגית.

עבור רמות הספק עד וואטים בודדים, מחלקים את הקרינה האלקטרומגנטית ל – 3 תחומי ספקטרום:

• אולטרא-סגול קצר מאוד – הפוטון מגיב עם החלבונים, ריאקציה ישירה עם RNA, DNA. בדרך כלל התא החי מת כתוצאה מאינטראקציה עם קרינת לייזר באורכי גל אלו.
• אולטרא-סגול קרוב ואורכי גל קצרים של הספקטרום הנראה – ריאקציה פוטוכימית כגון פוטוסינטזה. בעיקר משתמשים בכך בלייזרי אקסימר.
• תחום נראה (מעל כחול) ואינפרא-אדום – אפקטים תרמיים כתוצאה מבליעת הקרינה האלקטרומגנטית על ידי הריקמה הביולוגית, וחימום הנובע מכך.