החסרה (Deletion) – אובדן של מקטע DNA מכרומוזום. האובדן יכול להיות של נוקלאוטיד יחיד או של מקטע DNA ארוך יותר. לעיתים אובדן יכול לגרום למחלה או להופעת פנוטיפ שאינו נורמלי ולעיתים אין לו השפעה כלל.