- הרוח אינה מקור יציב להפקת אנרגיה, בכל שעות היממה, ובכל עונות השנה. אספקת חשמל מטחנות רוח מותנית בתנאי רוח מתאימים, ולכן אינה יכולה להיות מקור בלעדי לאספקת חשמל, אלא חייבת לבוא בשילוב עם מקורות אנרגיה אחרים.
- מחיר הקמה ראשוני גבוה של טחנת הרוח – ככל שגדל השימוש בטורבינות רוח, מוזל מחירן, וגדלה יעילותן.
- ניצול אנרגיית הרוח, מוגבל לאזורים בהם נושבות רוחות מתאימות.
- יש הטוענים לפגיעה בנוף – זאת למרות שהמקומות בהם הוקמו בקליפורניה חוות הרוח, הפכו לאתרי תיירות.
- יש הטוענים לפגיעה בעופות, כתוצאה מהלהבים המסתובבים – כיום משתמשים בצבעים בולטים לצביעת הלהבים, ובעיה זו הוקטנה למינימום.
- לעיתים קיימת בעיית רעש, הנוצר כתוצאה מסיבוב הלהבים. שימוש בטכנולוגיות מתקדמות, הפחית את מידת הרעש, ובנוסף, ממקמים את חווות הרוח במרחק ממקום יישוב.
- יש הטוענים שלהבי הטורבינה המסתובבים גורמים להפרעות אלקטרומגנטיות לשידורים אלחוטיים באזור. כתוצאה מכך נוצרות הפרעות בקליטת שידורי טלביזיה. פתרונות לכך הם: טלביזיה בכבלים, אנטנות מרכזיות, התאמת מיקום חוות הרוח לטחנות הממסר של שידורי הטלביזיה, שימוש בחומרים מרוכבים לא מתכתיים (כגון פיברגלס) לבניית כנפי הרוטור.
- הרוח אינה מרוכזת, ולכן נדרש שטח גדול של כנפי הרוטור כדי לנצל את אנרגיית הרוח.
