{"id":350,"date":"2016-08-16T11:56:02","date_gmt":"2016-08-16T08:56:02","guid":{"rendered":"https:\/\/stwww1.weizmann.ac.il\/bioinformatics\/?page_id=350"},"modified":"2016-08-16T11:56:02","modified_gmt":"2016-08-16T08:56:02","slug":"blast-explanation-en","status":"publish","type":"page","link":"https:\/\/stwww1.weizmann.ac.il\/bioinformatics\/blast-explanation-en\/","title":{"rendered":"BLAST"},"content":{"rendered":"<p style=\"direction: ltr\"><a class=\"glossaryLink\"  aria-describedby=\"tt\"  data-cmtooltip=\"&lt;div class=glossaryItemTitle&gt;Blast&lt;span class=&amp;quot;dashicons &amp;quot; data-icon=&amp;quot;&amp;quot; style=&amp;quot;color:#000;display:inline;vertical-align:baseline;&amp;quot;&gt;&lt;\/span&gt;&lt;\/div&gt;&lt;div class=glossaryItemBody&gt;Blast &ndash; &#1514;&#1493;&#1499;&#1504;&#1514; &#1502;&#1495;&#1513;&#1489; &#1513;&#1497;&#1513; &#1500;&#1492; &#1488;&#1514; &#1492;&#1497;&#1499;&#1493;&#1500;&#1514; &#1500;&#1492;&#1513;&#1493;&#1493;&#1514; &#1489;&#1497;&#1503; &#1512;&#1510;&#1508;&#1497;&#1501;. &#1489;&#1488;&#1502;&#1510;&#1506;&#1493;&#1514; &#1514;&#1493;&#1499;&#1504;&#1492; &#1494;&#1493; &#1504;&#1497;&#1514;&#1503; &#1500;&#1494;&#1492;&#1493;&#1514; &#1500;&#1502;&#1513;&#1500; &#1490;&#1504;&#1497;&#1501; &#1492;&#1493;&#1502;&#1493;&#1500;&#1493;&#1490;&#1497;&#1501; (&#1489;&#1506;&#1500;&#1497; &#1512;&#1510;&#1507; &#1491;&#1493;&#1502;&#1492;) &#1489;&#1497;&#1510;&#1493;&#1512;&#1497;&#1501; &#1513;&#1493;&#1504;&#1497;&#1501; &#1499;&#1502;&#1493; &#1488;&#1491;&#1501;, &#1494;&#1489;&#1493;&#1489; &#1508;&#1497;&#1512;&#1493;&#1514; &#1488;&#1493; &#1514;&#1493;&#1500;&#1506;&#1514;, &#1500;&#1495;&#1508;&#1513; &#1512;&#1510;&#1507; &#1489;&#1500;&#1514;&#1497; &#1497;&#1491;&#1493;&#1506; &#1489;&#1502;&#1488;&#1490;&#1512; &#1499;&#1500; &#1492;&#1512;&#1510;&#1508;&#1497;&#1501; &#1513;&#1500; &#1492;&#1490;&#1504;&#1493;&#1501;, &#1493;&#1506;&#1493;&#1491;.&lt;\/div&gt;\"  href=\"https:\/\/stwww1.weizmann.ac.il\/bioinformatics\/glossary\/blast\/\"  data-gt-translate-attributes='[{\"attribute\":\"data-cmtooltip\", \"format\":\"html\"}]'>BLAST<\/a> (<strong>B<\/strong>asic <strong>L<\/strong>ocal <strong>A<\/strong>lignment <strong>S<\/strong>earch <strong>T<\/strong>ool), is a sequence alignments tool, which provides a powerful way to compare novel sequences with previously characterized genes. <a class=\"glossaryLink\"  aria-describedby=\"tt\"  data-cmtooltip=\"&lt;div class=glossaryItemTitle&gt;Blast&lt;span class=&amp;quot;dashicons &amp;quot; data-icon=&amp;quot;&amp;quot; style=&amp;quot;color:#000;display:inline;vertical-align:baseline;&amp;quot;&gt;&lt;\/span&gt;&lt;\/div&gt;&lt;div class=glossaryItemBody&gt;Blast &ndash; &#1514;&#1493;&#1499;&#1504;&#1514; &#1502;&#1495;&#1513;&#1489; &#1513;&#1497;&#1513; &#1500;&#1492; &#1488;&#1514; &#1492;&#1497;&#1499;&#1493;&#1500;&#1514; &#1500;&#1492;&#1513;&#1493;&#1493;&#1514; &#1489;&#1497;&#1503; &#1512;&#1510;&#1508;&#1497;&#1501;. &#1489;&#1488;&#1502;&#1510;&#1506;&#1493;&#1514; &#1514;&#1493;&#1499;&#1504;&#1492; &#1494;&#1493; &#1504;&#1497;&#1514;&#1503; &#1500;&#1494;&#1492;&#1493;&#1514; &#1500;&#1502;&#1513;&#1500; &#1490;&#1504;&#1497;&#1501; &#1492;&#1493;&#1502;&#1493;&#1500;&#1493;&#1490;&#1497;&#1501; (&#1489;&#1506;&#1500;&#1497; &#1512;&#1510;&#1507; &#1491;&#1493;&#1502;&#1492;) &#1489;&#1497;&#1510;&#1493;&#1512;&#1497;&#1501; &#1513;&#1493;&#1504;&#1497;&#1501; &#1499;&#1502;&#1493; &#1488;&#1491;&#1501;, &#1494;&#1489;&#1493;&#1489; &#1508;&#1497;&#1512;&#1493;&#1514; &#1488;&#1493; &#1514;&#1493;&#1500;&#1506;&#1514;, &#1500;&#1495;&#1508;&#1513; &#1512;&#1510;&#1507; &#1489;&#1500;&#1514;&#1497; &#1497;&#1491;&#1493;&#1506; &#1489;&#1502;&#1488;&#1490;&#1512; &#1499;&#1500; &#1492;&#1512;&#1510;&#1508;&#1497;&#1501; &#1513;&#1500; &#1492;&#1490;&#1504;&#1493;&#1501;, &#1493;&#1506;&#1493;&#1491;.&lt;\/div&gt;\"  href=\"https:\/\/stwww1.weizmann.ac.il\/bioinformatics\/glossary\/blast\/\"  data-gt-translate-attributes='[{\"attribute\":\"data-cmtooltip\", \"format\":\"html\"}]'>BLAST<\/a> is a program that compares sequences in order to identify similarity between them. Using this program, a given sequence (the query sequence) can be compared with thousands of other sequences in international databases (blastn). The query sequence can also be compared with another given sequence (blast2seq). The databases contain information on nucleotides (<a class=\"glossaryLink\"  aria-describedby=\"tt\"  data-cmtooltip=\"&lt;div class=glossaryItemTitle&gt;DNA&lt;span class=&amp;quot;dashicons &amp;quot; data-icon=&amp;quot;&amp;quot; style=&amp;quot;color:#000;display:inline;vertical-align:baseline;&amp;quot;&gt;&lt;\/span&gt;&lt;\/div&gt;&lt;div class=glossaryItemBody&gt;DNA (&amp;lt;span dir=&amp;quot;ltr&amp;quot;&amp;gt;Deoxyribonucleic acid&amp;lt;\/span&amp;gt;) &ndash; &#1502;&#1493;&#1500;&#1511;&#1493;&#1500;&#1492; &#1513;&#1500; &#1495;&#1493;&#1502;&#1510;&#1514; &#1490;&#1512;&#1506;&#1497;&#1503; &#1492;&#1502;&#1488;&#1495;&#1505;&#1504;&#1514; &#1488;&#1514; &#1492;&#1502;&#1497;&#1491;&#1506; &#1492;&#1514;&#1493;&#1512;&#1513;&#1514;&#1497; &#1492;&#1495;&#1497;&#1493;&#1504;&#1497; &#1500;&#1502;&#1489;&#1504;&#1501; &#1493;&#1514;&#1508;&#1511;&#1493;&#1491;&#1501; &#1513;&#1500; &#1492;&#1497;&#1510;&#1493;&#1512;&#1497;&#1501; &#1493;&#1502;&#1488;&#1508;&#1513;&#1512;&#1514; 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&#1492;-DNA &#1502;&#1488;&#1493;&#1512;&#1490;&#1504;&#1493;&#1514; &#1489;&#1499;&#1512;&#1493;&#1502;&#1493;&#1494;&#1493;&#1502;&#1497;&#1501;.&lt;\/div&gt;\"  href=\"https:\/\/stwww1.weizmann.ac.il\/bioinformatics\/glossary\/dna\/\"  data-gt-translate-attributes='[{\"attribute\":\"data-cmtooltip\", \"format\":\"html\"}]'>DNA<\/a>, <a class=\"glossaryLink\"  aria-describedby=\"tt\"  data-cmtooltip=\"&lt;div class=glossaryItemTitle&gt;RNA&lt;span class=&amp;quot;dashicons &amp;quot; data-icon=&amp;quot;&amp;quot; style=&amp;quot;color:#000;display:inline;vertical-align:baseline;&amp;quot;&gt;&lt;\/span&gt;&lt;\/div&gt;&lt;div class=glossaryItemBody&gt;RNA (&amp;lt;span dir=&amp;quot;ltr&amp;quot;&amp;gt;Ribonucleic acid&amp;lt;\/span&amp;gt;) &ndash; &#1495;&#1493;&#1502;&#1510;&#1514; &#1490;&#1512;&#1506;&#1497;&#1503; &#1492;&#1504;&#1489;&#1504;&#1497;&#1514; &#1506;&#1500; &#1490;&#1489;&#1497; &#1514;&#1489;&#1504;&#1497;&#1514; &#1513;&#1500; DNA &#1493;&#1502;&#1492;&#1493;&#1493;&#1492; 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(&amp;lt;span dir=&amp;quot;ltr&amp;quot;&amp;gt;tRNA&amp;lt;\/span&amp;gt;), RNA-&#1512;&#1497;&#1489;&#1493;&#1494;&#1493;&#1502;&#1500;&#1497; (rRNA).&lt;\/div&gt;\"  href=\"https:\/\/stwww1.weizmann.ac.il\/bioinformatics\/glossary\/rna\/\"  data-gt-translate-attributes='[{\"attribute\":\"data-cmtooltip\", \"format\":\"html\"}]'>RNA<\/a>) or proteins. Any scientist identifying a new sequence forwards it to the databases, so that the databases are constantly being updated. <a class=\"glossaryLink\"  aria-describedby=\"tt\"  data-cmtooltip=\"&lt;div class=glossaryItemTitle&gt;Blast&lt;span class=&amp;quot;dashicons &amp;quot; data-icon=&amp;quot;&amp;quot; style=&amp;quot;color:#000;display:inline;vertical-align:baseline;&amp;quot;&gt;&lt;\/span&gt;&lt;\/div&gt;&lt;div class=glossaryItemBody&gt;Blast &ndash; &#1514;&#1493;&#1499;&#1504;&#1514; &#1502;&#1495;&#1513;&#1489; &#1513;&#1497;&#1513; &#1500;&#1492; &#1488;&#1514; &#1492;&#1497;&#1499;&#1493;&#1500;&#1514; &#1500;&#1492;&#1513;&#1493;&#1493;&#1514; &#1489;&#1497;&#1503; &#1512;&#1510;&#1508;&#1497;&#1501;. &#1489;&#1488;&#1502;&#1510;&#1506;&#1493;&#1514; &#1514;&#1493;&#1499;&#1504;&#1492; &#1494;&#1493; &#1504;&#1497;&#1514;&#1503; &#1500;&#1494;&#1492;&#1493;&#1514; &#1500;&#1502;&#1513;&#1500; &#1490;&#1504;&#1497;&#1501; &#1492;&#1493;&#1502;&#1493;&#1500;&#1493;&#1490;&#1497;&#1501; (&#1489;&#1506;&#1500;&#1497; &#1512;&#1510;&#1507; &#1491;&#1493;&#1502;&#1492;) &#1489;&#1497;&#1510;&#1493;&#1512;&#1497;&#1501; &#1513;&#1493;&#1504;&#1497;&#1501; &#1499;&#1502;&#1493; &#1488;&#1491;&#1501;, &#1494;&#1489;&#1493;&#1489; &#1508;&#1497;&#1512;&#1493;&#1514; &#1488;&#1493; &#1514;&#1493;&#1500;&#1506;&#1514;, &#1500;&#1495;&#1508;&#1513; &#1512;&#1510;&#1507; &#1489;&#1500;&#1514;&#1497; &#1497;&#1491;&#1493;&#1506; &#1489;&#1502;&#1488;&#1490;&#1512; &#1499;&#1500; &#1492;&#1512;&#1510;&#1508;&#1497;&#1501; &#1513;&#1500; &#1492;&#1490;&#1504;&#1493;&#1501;, &#1493;&#1506;&#1493;&#1491;.&lt;\/div&gt;\"  href=\"https:\/\/stwww1.weizmann.ac.il\/bioinformatics\/glossary\/blast\/\"  data-gt-translate-attributes='[{\"attribute\":\"data-cmtooltip\", \"format\":\"html\"}]'>BLAST<\/a> was developed by the NCBI and is accessible to the public on the Internet. <a class=\"glossaryLink\"  aria-describedby=\"tt\"  data-cmtooltip=\"&lt;div class=glossaryItemTitle&gt;Blast&lt;span class=&amp;quot;dashicons &amp;quot; data-icon=&amp;quot;&amp;quot; style=&amp;quot;color:#000;display:inline;vertical-align:baseline;&amp;quot;&gt;&lt;\/span&gt;&lt;\/div&gt;&lt;div class=glossaryItemBody&gt;Blast &ndash; &#1514;&#1493;&#1499;&#1504;&#1514; &#1502;&#1495;&#1513;&#1489; &#1513;&#1497;&#1513; &#1500;&#1492; &#1488;&#1514; &#1492;&#1497;&#1499;&#1493;&#1500;&#1514; &#1500;&#1492;&#1513;&#1493;&#1493;&#1514; &#1489;&#1497;&#1503; &#1512;&#1510;&#1508;&#1497;&#1501;. &#1489;&#1488;&#1502;&#1510;&#1506;&#1493;&#1514; &#1514;&#1493;&#1499;&#1504;&#1492; &#1494;&#1493; &#1504;&#1497;&#1514;&#1503; &#1500;&#1494;&#1492;&#1493;&#1514; &#1500;&#1502;&#1513;&#1500; &#1490;&#1504;&#1497;&#1501; &#1492;&#1493;&#1502;&#1493;&#1500;&#1493;&#1490;&#1497;&#1501; (&#1489;&#1506;&#1500;&#1497; &#1512;&#1510;&#1507; &#1491;&#1493;&#1502;&#1492;) &#1489;&#1497;&#1510;&#1493;&#1512;&#1497;&#1501; &#1513;&#1493;&#1504;&#1497;&#1501; &#1499;&#1502;&#1493; &#1488;&#1491;&#1501;, &#1494;&#1489;&#1493;&#1489; &#1508;&#1497;&#1512;&#1493;&#1514; &#1488;&#1493; &#1514;&#1493;&#1500;&#1506;&#1514;, &#1500;&#1495;&#1508;&#1513; &#1512;&#1510;&#1507; &#1489;&#1500;&#1514;&#1497; &#1497;&#1491;&#1493;&#1506; &#1489;&#1502;&#1488;&#1490;&#1512; &#1499;&#1500; &#1492;&#1512;&#1510;&#1508;&#1497;&#1501; &#1513;&#1500; &#1492;&#1490;&#1504;&#1493;&#1501;, &#1493;&#1506;&#1493;&#1491;.&lt;\/div&gt;\"  href=\"https:\/\/stwww1.weizmann.ac.il\/bioinformatics\/glossary\/blast\/\"  data-gt-translate-attributes='[{\"attribute\":\"data-cmtooltip\", \"format\":\"html\"}]'>BLAST<\/a> was developed by the NCBI and is accessible to the public on the Internet.<\/p>","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>BLAST (Basic Local Alignment Search Tool), is a sequence alignments tool, which provides a powerful way to compare novel sequences with previously characterized genes. BLAST is a program that compares sequences in order to identify similarity between them. 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